刑事訴訟法第五十六條第二款規定：“當事人及其辯護人、訴訟代理人有權申請人民法院對以非法方法收集的證據依法予以排除。申請排除以非法方法收集的證據的，應當提供相關線索或者材料。”根據上述規定，對于非法證據排除申請，需要注意以下問題：

　　1.申請排除非法證據的主體。為了更好地發揮非法證據排除制度的功能，依法保證當事人的合法權益，刑事訴訟法規定申請的主體包括當事人及其辯護人、訴訟代理人。

　　2.申請排除非法證據的形式。申請的形式可以是書面申請，也可以是口頭申請。起訴書副本送達后開庭審判前，當事人及其辯護人、訴訟代理人申請人民法院排除以非法方法收集的證據的，應當向人民法院提交書面意見。當事人書寫確有困難的，可以口頭告訴，由人民法院工作人員或者其辯護人、訴訟代理人作出筆錄，并由當事人簽名或者捺指印。

　　3.申請排除非法證據的時間。法律對權利人提出申請規定了較為寬泛的時間，但通過實踐操作發現，如果不對權利人提出申請的時間進行適度引導和恰當的限制，很容易導致相關人在庭審中濫用權利。一旦權利人當庭提出的線索促使審判人員啟動調查程序，公訴人員面對突然來襲的非法證據申請，很難即刻舉證證明，而休庭準備相關證據勢必會拖延訴訟進程。而且，從司法實踐來看，個別案件中，非法證據排除占據開庭審理過多時間，導致庭審主次不分。完全的庭中排除使得庭審活動偏離了定罪量刑的主題，審判人員及控辯雙方忽視了對案件事實真相的調查，庭審的中心功能沒有實現。為避免訴訟資源被無謂地浪費，非法證據排除申請的提出應當被適度引導。刑事訴訟法第一百八十二條第二款增設了庭前會議制度，專門規定審判人員在開庭以前可以召集公訴人、當事人和辯護人、訴訟代理人，就非法證據排除問題，了解情況，聽取意見。因此，有必要充分利用庭前會議程序，盡量在庭前解決非法證據排除問題。根據這一修法精神，《刑事訴訟法司法解釋》在起草過程中曾規定：“當事人及其辯護人、訴訟代理人申請人民法院排除非法證據的，應當在起訴書副本送達后開庭前提出，但在開庭審理后才收集到相關線索或者材料的除外。”征求意見過程中，有意見認為，上述規定有限制當事人及其辯護人、訴訟代理人訴訟權利的嫌疑，未能同刑事訴訟法通過非法證據除增強對被告人訴訟權利保障的精神完全一致。因此，《刑事訴訟法司法解釋》第九十七條調整為：“人民法院向被告人及其辯護人送達起訴書副本時，應當告知其申請排除非法證據的，應當在開庭審理前提出，但在庭審期間才發現相關線索或者材料的除外。”

　　需要注意的是，在刑事訴訟中沒有類似于民事訴訟的舉證時限的規定。起草過程中，有意見認為，對于當事人及其辯護人、訴訟代理人在開庭前即掌握相關線索或者材料，但是在開庭審理后才提出非法證據排除申請的，法庭可以不再對證據收集的合法性進行調查，但在審查和采信相關證據時應當特別慎重。經慎重研究，《刑事訴訟法司法解釋》未采納上述建議，主要考慮：刑事訴訟畢竟不同于民事訴訟，不能因為當事人及其辯護人、訴訟代理人在開庭審理前未及時提出非法證據排除申請，就剝奪對其申請進行審查、繼而啟動證據合法性調查的程序性權利。但是，為了保證庭審有序進行，應當將該申請的審查時間交由法庭決定，以避免對庭審秩序和效率的影響。因此，《刑事訴訟法司法解釋》第一百條第三款進而規定：“法庭審理過程中，當事人及其辯護人、訴訟代理人申請排除非法證據，人民法院經審查，不符合本刑事訴訟法司法解釋第九十七條規定的，應當在法庭調查結束前一并進行審查，并決定是否進行證據收集合法性的調查。”

　　4.非法證據排除申請的條件。為了保證對非法證據調查的順利進行，避免申請和啟動非法證據排除程序的隨意性，規定申請非法證據排除應當提供線索或者材料。而且，提供線索或者材料均可，而線索的范圍比較廣泛，申請人提供應當不困難。考慮到被告方提供材料難以做到，才規定了被告方承擔舉證責任的最低要求，即提供線索即可。這不僅是應當的，而且是能夠做到的。①《刑事訴訟法司法解釋》第九十六條規定：“當事人及其辯護人、訴訟代理人申請人民法院排除以非法方法收集的證據的，應當提供涉嫌非法取證的人員、時間、地點、方式、內容等相關線索或者材料。”所謂“材料”，是指被告人出示的血衣、傷痕、傷痕照片、醫療證明、傷殘證明、同監人的證言等能夠證明存在刑訊逼供等非法取證事實的證據材料;所謂“線索”，是指可以顯示刑訊逼供等非法取證確實存在的比較具體的事實，如關于刑訊逼供的時間、地點、方式及涉嫌刑訊逼供的人員等信息。

　　5.對非法證據排除申請材料的處理。根據《刑事訴訟法司法解釋》第九十八條的規定，開庭審理前，當事人及其辯護人、訴訟代理人申請人民法院排除非法證據的，人民法院應當在開庭前及時將申請書或者申請筆錄及相關線索、材料的復制件送交人民檢察院。這一規定的目的在于強調人民法院要及時將相關材料移送人民檢察院，以便于人民檢察院對非法證據排除的申請做相應準備，避免出現一開庭才知曉對方提出非法證據排除申請，從而影響庭審順利進行。

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